学校本科阶段设有法文学部、观光产业科学部、教育学部、理学部、医学部、工学部、农学部等七个学部。

研究生阶段设有人文社会科学研究科、观光科学研究科、教育学研究科、医学研究科、保健学研究科、农学研究科、理工学研究课、鹿儿岛大学大学院联合研究科、法务研究科等九个研究科。

研究生院的理工学研究科，从2007年度起，为来自亚洲太平洋岛屿等国家的公费和自费留学生，提供特殊研究计划。考虑到外国留学生的招收，每年10月至次年9月为一学年，全部用英语进行授课。

硕士设有如电子电气工程、法务学、旅游学、国际岛屿保健学、国际语言文化、海洋自然科学、环境建设工程、机械系统工程、理科教育、临床心理学、信息工程、人类健康开发学、人类科学、数理科学、特殊援助教育、物质地球学、学校教育、亚热带农学、医科学、社会系统学等专业方向。博士设有如比较地域文化、法务学、感染控制医学、国际岛屿保健学、海洋环境学、理科教育、临床心理学、人类健康开发学、生产能源工程、特殊援助教育、学校教育、亚热带农学、医科学、综合智能工程等专业方向。

琉球大学坐落于冲绳县,中头郡，是冲绳县内唯一的，也是日本最南端和最西端的国立大学。地理位置优越，环境优美。